Freskerne i Elmelunde Kirke er kendt for deres rige og varierede farveskala, som domineres af jordfarver. De mest fremtrædende nuancer inkluderer okkergul, rødbrun og forskellige toner af terrakotta. Disse varme farver danner en kontrast til de køligere grå og hvide nuancer i kalkgrunden.
Udover de dominerende jordfarver finder man også spor af blå og grønne pigmenter, selvom disse ofte er mere dæmpede eller falmede over tid. Farvevalget var præget af datidens tilgængelige materialer, hvor naturlige mineraler blev brugt til at skabe de visuelle fortællinger på væggene.
De nuværende farver i kirken er resultatet af århundreders bevaring og restaurering. Det anbefales at besøge kirken for at se de autentiske kalkmalerier direkte, da lysforholdene inde i bygningen kan ændre oplevelsen af farverne.